Dicho sitio es una área de 52 m2 (32 m2 exclusivamente para el repositorio del acervo histórico y 20 m2 para las áreas de consulta y restauración), ubicado en la planta baja poniente del edificio que aloja a la biblioteca del Centro, cuenta con 11 anaqueles metálicos de acero inoxidable, distribuidos en cuatro baterías, donde está colocado el patrimonio documental histórico, fotográfico, audiovisual y algunas piezas de museo del CIIDIR Oaxaca, en las condiciones lo más adecuadas para evitar su deterioro o destrucción.
El Archivo Histórico del CIIDIR Oaxaca, inaugurado el 15 de noviembre de 2013 por el Ing. Jesús Ávila Galinzoga, presidente del Decanato del IPN, y los doctores Rafael Pérez Pacheco, director del CIIDIR Oaxaca, y José Rodolfo Martínez y Cárdenas, maestro Decano del Centro, es un lugar donde se resguarda debida y correctamente el patrimonio histórico documental rescatado de la institución; se vigila que sea preservado en las condiciones adecuadas que evite su destrucción. Lo constituyen material fotográfico, audiovisual, objetos y documentos no solo antiguos necesariamente, como pueden serlos muchos de ellos, sino fundamentalmente seleccionados por la trascendencia e importancia de su contenido, vale decir por su valor permanente. Así mismo, es un espacio donde se propicia el interés de la comunidad politécnica para investigar y conocer aspectos relacionados con el acontecer institucional, tendiente al fortalecimiento de su identidad.
El Archivo Histórico tiene como propósito proporcionar a los usuarios información con sustento documental para la realización de estudios históricos, administrativos e investigaciones generales de aspectos relacionados con el devenir institucional. Su acervo histórico está constituido hasta ahora por documentos impresos, fotografías impresas y digitalizadas, material gráfico y audiovisual, cuya vigencia administrativa, fiscal, contable o legal ha concluido y su contenido es evidencial, testimonial o informativo.
El Archivo Histórico del CIIDIR Oaxaca quedó inscrito el 4 de octubre de 2013 en el Registro Nacional de Archivos del AGN con el código MX09016AHCIIDIROLCR, del cual, se cuenta con el respectivo certificado formulado por el Archivo General de la Nación. El Registro Nacional de Archivos Históricos es un instrumento catastral del Archivo General de la Nación para registrar y difundir el patrimonio de la memoria documental del país resguardado en los archivos históricos del Poder Ejecutivo Federal, y de manera potestativa, de otros archivos públicos y privados. El registro integrará los datos sobre los acervos y la infraestructura de los archivos, así como sobre los documentos declarados patrimonio documental de la Nación. El Código internacional para los archivos mexicanos inicia con MX, y la fecha, entidad y las siglas del nombre del archivo.