Se ha registrado como Unidad de Manejo y Aprovechamiento de Vida Silvestre "SERMANAP-UMA-JB-00120AX", tiene establecidos más de 1000 individuos distribuidos en más de 200 especies. Está formado por las áreas de cactáceas y suculentas (Mixteca, Cañada, Istmo y Tehuacán Cuicatlán), agaváceas y área experimental de propagación.
Es un área que tiene los medios para resguardar los especímenes herborizados; cuenta con espacio para preparar los especímenes, secado, herborizado e identificación. El Herbario del CIIDIR-Oaxaca es una colección de plantas secas, iniciada en 1984. De acuerdo con la Ley General del Equilibrio Ecológico y la Protección al Ambiente, se encuentra registrada ante la SEMARNAT con la clave OAX-FLO-129-0402 y en el Index Herbariorum (Holmgren & Holmgren, 1990) con el acrónimo OAX. Sus objetivos fundamentales son formar, conservar e incrementar continuamente una colección científica de plantas vasculares con especial énfasis en especies nativas del estado de Oaxaca. Su misión es ser un centro de información fundamental para el estudio de las plantas vasculares del estado de Oaxaca. La colección está formada por 28,304 ejemplares de plantas vasculares, de los cuales 20,055 son colectas de localidades en el estado de Oaxaca.
Actualmente el área experimental está constituida por invernaderos y área experimental, así como camas para el cultivo de lombrices, que a continuación se describen.
Se tienen dos hectáreas para la investigación y transferencia de tecnología en especies vegetales nativas y de interés económico como: Hylocereus, Physalis, Capsicum, Agave etc, En 2000 m2 se tiene doce invernaderos de diferentes formas y tamaños para estudios en cultivos hidropónicos, y en 5000 m2 para cultivos al aire libre. La superficie restante; que es de una hectárea, aun esta sin utilizar. Las áreas actualmente ocupadas cuentan con sistema de riego por goteo, una estación climatológica y equipo de monitoreo de condiciones ambientales, así como un medidor de fotosíntesis IRGA, LI-6400XT.
La utilización de sustancias químicas para el control de insectos, aun y cuando se consideran métodos efectivos, han originado diversos problemas de contaminación al ambiente además de generar resistencia en los insectos plaga, por lo que en este laboratorio se realizan búsquedas para investigar el potencial uso de alternativas biorracionales para definir los tratamientos más eficientes del manejo de plagas. Se utiliza para la cría masiva de nematodos parásitos de mosquitos, equipado con Microscopios y equipo para la observación y disección del cultivo del nematodo para el control de mosquitos transmisor del dengue.
Se realiza el diseño y construcción de piezas mecánicas para prototipos derivados de la investigación y maquinaria solicitada por el sector productivo. Se cuenta con tornos, fresadoras, soldadora, maquinaria para corte y doblado de lámina.